1、入口不同：微信碎片化，百度中心化。
张小龙一直强调微信小程序没有入口，然而事实上，微信现在已为小程序开放64个入口，2018年5月访问量排名前五的入口依次是微信群聊入口、微信聊天主界面下拉、APP分享信息卡片、发现栏小程序主入口、发现栏小程序主入口搜索框的搜索结果页，还有消息称微信希望增加下拉栏的容量，并改变目前横向划动的呈现方式，给更多小程序更多入口。
与微信小程序入口分散在各处需要开发者绞尽脑汁去获取流量不同，百度智能小程序入口更加集中，百度将开放搜索、信息流、贴吧在内的千亿流量，同时会进入哔哩哔哩、58同城等第三方应用，进行中心化的分化，给开发者可预期的流量。不论什么行业、什么类型的小程序开发者都可以找到流量，特别是这些流量还可以经营和沉淀，可以更好帮助开发者更加精准地获得用户。
针对这种不同，开发者只需要专注做好应用体验，而不用将过多精力放在流量用户获取上。不论是搜索引擎还是信息流，百度最擅长的就是长尾分发，让中小开发者或者内容创作者有流量，未来百度智能小程序或许也会形成这样的长尾效应，给更多中小开发者机会。
2、能力不同：微信强社交，百度重AI。
在给开发者提供的支持上，百度和微信小程序都是在构建一套应用协议和标准，不过两者侧重的能力也有所不同，微信更加重视社交能力，让小程序可以调用聊天会话、朋友圈分享、通讯录等能力，而百度则将其最擅长的AI技术包装成包括语音、文字、图像和人脸识别等在内的能力，帮助小程序实现智能交互、智能推荐、数据挖掘，进而增强用户体验。
智能小程序是百度智能开放生态的重要组成部分，也是百度在AI时代的关键产品，在AI开发者大会上推出，足以体现出AI对它的重要性。在AI上百度比腾讯走得更远，马化腾本人曾在公开场合强调。对于开发者来说，让小程序吃到AI技术，增强用户体验、获取精准流量和提高企业价值，何乐而不为？
此外，百度智能小程序对开发者相对友好，微信要平衡公众号和小程序的关系，坚决不让小程序有关注功能，让用户用完即走。百度允许用户关注小程序，帮助开发者将用户获取-沉淀-唤醒-变现，通过关注功能沉淀下来，再通过Push+Feed帮助开发者唤醒用户，通过广告组件帮助开发者自主变现。
3、开放不同：微信封闭式，百度全开放。
微信小程序只在微信生态内有效，微信只支持自有小程序。百度则宣称“智能小程序是业界首个完全开放的小程序生态。”这样说不是没有道理，一方面，百度将兼容第三方小程序，包括但不限于微信，开发者只要简单修改小程序代码就可以变为百度智能小程序；另一方面，百度将对小程序进行开源，进而确保所有应用都能兼容百度智能小程序，理论上来说，第三方App也可以基于这套开源架构打造属于自己的小程序体系。未来，百度智能小程序甚至可以兼容穿戴设备、智能家居和车载系统等IoT设备，体现出绝对的开放性。
百度智能小程序生态已有许多重量级伙伴，爱奇艺，优信二手车，携程旅行，唯品会、苏宁易购以及春雨医生等平台都已加入百度智能小程序生态，百度智能小程序不只是一个属于百度App超级应用的协议，而是属于整个移动互联网的，百度在其中扮演着制定应用规则、提供基础能力和整合各类服务的角色。
一个是百度旗下的产品，一个是腾讯旗下的产品，肯定是百度的产品更广，推广效果也就越好
